清理整頓黨政機關和事業單位“小金庫”，是規范經濟秩序、實現政府性財力與公共資源管理的完整性、從根本上防范公權扭曲和腐敗行徑的重要措施。經過多次清理之后，人們特別關心的是如何真正防止“小金庫”像“割韭菜”似的再生一茬，即如何形成防治“小金庫”的長效機制？我認為，解決這一問題的關鍵，是使相關制度建設更好達到健全性、可行性、有效性。第一，根絕“小金庫”滋生，根本上必須依靠制度建設，再輔之以思想教育等；第二，制度框架必須實現全覆蓋，“橫向到邊，縱向到底”，不留死角；第三，制度的實施必須具備可行性、合理性。比如，要合乎政策、理性地處理好我國經濟社會轉軌中，企事業單位探索與開創中的某些試驗及一些在財務管理上的模糊、過渡事項，從“在發展中規范”，最后上升為“在規范中發展”，逐步落實相關法規的可操作性，并動態增進其合理性；第四，管理制度的有效性和可靠性，要逐步表現為依靠法規體系來鎖定，即積極努力上升到“有法可依”、“有法必依”的法治化層面。
