在學校新學期開學的前一天，衛生部專門就防控甲型H1N1流感舉行了倡議活動，特別強調學校及托幼機構要建立應對甲型H1N1流感預案，加強防控工作，防范秋季開學后甲型H1N1流感在學校內的暴發流行。此前，世衛組織也發布了關于秋冬甲型H1N1流感病毒爆發的警告。
    據衛生部最新統計，8月28日15時至8月31日15時，我國內地新增甲型H1N1流感確診病例359例，其中45例為境外輸入性病例，314例為境內感染病例。而近日在河南新安縣第三高中和甘肅蘭州市一所中學相繼發生的甲型H1N1流感暴發疫情與清華新生中的確診病例，則讓人們對開學后學生們的集中，會否引發新一輪疫情傳播顯得憂心忡忡。
    衛生部副部長尹力在甲型H1N1流感倡議活動中表示，雖然目前內地尚無死亡病例，但隨著秋季到來和學生們的集中返校，并不排除這種可能性。同時在我國可能出現局部的疫情重癥。
    而受到甲型H1N1疫情威脅的群體遠不止在校師生。歐洲地區各衛生機構近日發出警告，今年秋冬，歐洲可能有1/3人口感染甲型H1N1流感病毒。而據路透社報道，美國總統科技顧問委員會已開始敦促食品和藥物管理局盡快就流感藥物的新靜脈制劑作出決定并啟動疫苗灌裝工作以應對可能發生的疫情爆發。
    疫情在亞洲國家中的情形也不容樂觀。根據過去5年季節性流感流行情況，日本厚生勞動省預測，日本年內可能有20%至30%人口感染甲型H1N1流感，9月下旬至10月上旬可能迎來爆發高峰。高峰期間，每天新感染病例將達76萬人。截至8月31日，印度的甲型H1N1流感確診病例已達3987例，死亡病例則已高達百例。
    世界衛生組織8月28日在每周一次的流感疫情通報中指出，甲型H1N1流感病毒已成為今年最流行的流感病毒。通報中說，在南半球大部分地區，流感疫情高峰已過，但在北半球，甲型流感才開始進入流行期，秋冬季將迎來疫情高峰。對此，中國疾病防控中心流行病學專家也表示：“繼8月21日陳竺部長公布了甲型H1N1流感病例比重后，我國甲流的監測數字保持著上升的趨勢，目前已占總流感監測數量近8%。”