國家“十二五”規劃提出，健全覆蓋城鄉居民的基本醫療保障體系，進一步完善城鎮職工基本醫療保險、城鎮居民基本醫療保險、新型農村合作醫療和城鄉醫療救助制度。建立和完善以國家基本藥物制度為基礎的藥品供應保障體系，加強藥品生產管理，整頓藥品流通秩序，規范藥品集中采購和醫療機構合理用藥。
這充分顯示出，醫保擴容和以基本藥物制度為基礎的藥品供應保障體系將對我國醫藥產業產生重大的變革。據估算，未來五年時間，我國藥品銷售總量可能會突破2萬億。
“十二五”期間，具有質量和成本優勢的藥品生產企業面臨復雜的產業機會；一方面，處方藥市場的優勝劣汰加速，具有品種優勢、新藥研發優勢的強勢企業將“剩”者為王；另一方面，OTC市場將迎來一個更加激烈的競爭時代，全民醫保的消費分流，市場份額可能萎縮，如何形成品牌壁壘將成為醫藥企業的核心競爭力。
未來五年，對于中國生物醫藥行業是“調結構，促升級”的關鍵五年。國家通過政策引導等多種手段，促進中國生物醫藥行業的整體升級，行業同樣面臨重組與發展的機會。有望形成以央企為第一集團的生物醫藥企業梯隊；地方國資委推動的地方國有企業，以及優質民營醫藥企業，共同組成第二梯隊。而資質不理想、產能落后的企業將被淘汰出局。
在“十二五”末，我國醫藥流通市場的總規模將達到9000億元，保持年增長10%的速度。目前我國的醫藥流通企業總量多達13000家，而規模實力和利潤水平比較理想的企業僅占其中極少數。未來，國內醫藥流通企業的兼并重組將成為常態。在“十二五”完成整合之后，中國市場將會形成眾多醫藥公司、少數流通大企業、眾多醫院藥店的商業業態。這種業態決定了醫藥流通企業的利潤率有可能大幅上升。
我國醫藥進出口在“十二五”期間將迎來巨大的發展機遇。2011年至2015年間，將有銷售額為770億美元的專利藥到期，專利失效釋放出的巨大市場容量，對中國醫藥企業無疑是利好因素。中國醫藥企業面臨全球醫藥外包向亞洲轉移的機遇，要提高承接國際醫藥產業轉移和吸納的能力，通過與國外原研藥廠商洽談從原料藥到制劑的全面合作，獲得大規模制劑訂制合同。而使用自身廉價原料藥也必將增厚利潤，同時可能獲得授權仿制或首仿的機會，并可借助合作伙伴的營銷渠道將產品打入國際市場。
當然，機遇同風險是并存的。未來五年也將是國際化競爭程度很高的五年，我國醫療衛生需求在不斷增長，跨國制藥公司把目光投向中國。我國制藥工業的整體銷售利潤率不到10%，而世界制藥50強的平均銷售利潤率達到18%，世界最大的制藥企業輝瑞的凈利潤率為16.78%。從效益水平、創新能力等方面來看，中國的醫藥企業還要多下功夫，否則“十二五”規劃帶來的政策春風更多地將被世界制藥巨頭蠶食。