“公立醫院改革試點方案”本應在2009年底出臺，但現在不得不推遲。究其原因，全國不同地區的公立醫院復雜的權屬關系以及隨之而來的補償機制不到位，是該方案不得不延期的主要原因。這引發網友對公立醫院改革的議論。

　　公立醫院補償渠道不暢

　　新浪博主“宜昌人可”指出，近年來，公立醫療機構收入受到限制，而支出卻要按政策和市場運作，業務收支虧損嚴重。這主要體現在收入增長受到限制、支出增長因素較多、依靠負債推動發展。但是，公立醫院的補償渠道卻不暢通。“宜昌人可”說，醫療服務價格4年未作調整，這與其間居民消費價格及醫用材料價格的不斷上漲是不相協調的。另外，財政補助水平基本未變，特別是工資制度改革后并未增加相應的財政補助。
　　此外，還有網友認為，醫改新政對公立醫院改革效果尚有待觀察。取消藥品加成會使公立醫院的運行更加困難，頻繁調整醫療服務價格和大幅增加財政投入的可能性不大，取消藥品加成并不一定能達到制度設計之初衷。

　　會否被逼走“市場化”道路

　　有網友擔心，公立醫院在補償機制不到位的情況下，會被逼上市場化道路。
　　廣東省衛生廳副廳長廖新波在博客中寫道：一些地方政府醫院的公益性將難以得到保證，甚至被迫走上市場化的道路。廖新波認為，如果公立醫院改革是在缺乏財政的有力支撐、缺乏醫保制度同步改革的情況下進行，公益性將難以保證。
　　馬鞍山市醫療集團總院長何少峰也指出，北京、上海等大城市并不用擔心沒錢，地級市的醫院根本拿不到充足的財政投入，怎么辦，自己想辦法。

　　改制重組是必由之路

　　在公立醫院改革擱淺之時，許多網友認為，改制重組是必由之路。
　　新浪博主“醫生哥波子”說，我們對公立醫院的改革一直認為是產權不清的問題。
　　新浪網友寫道：目前問題在于，公立醫院的法人治理結構多不規范，所有權、決策權、經營權、監督權模糊不清，再加上政府的投入不足，由此導致多數公立醫院的逐利傾向，將經濟目標凌駕于社會目標之上，使公立醫院難以姓“公”。
　　新浪博主“宜昌人可”也指出，改制重組是深化公立醫院改革的必由之路，不觸及產權制度的改革是膚淺的，是難于深度推進的，也是難于達到改革目的的。既然如此多的公立醫院全部由政府來“主導”既無必要也不現實，那就只好痛下決心，堅定不移地保留一部分、改制一部分。接下來的問題是，要保留多少公立醫院，以及保留哪些醫院。保留的公立醫院的數量、規模要適度，不能“賣光”、“改凈”，這不僅涉及傳統的辦醫體制問題，也涉及政府權力(責任)邊界的界定問題。具體保留多少應根據城市規模大小確定，以體現政府責任、滿足群眾需求、有利于臨床醫學發展為原則。
　　此外，除保留的公立醫院外，現有其他公立醫院應進行改制重組，市場化運作。一是實行產權多元化，通過實施股份制改造，吸收非國有資本加入，形成混合所有制醫院。二是產權重新安排，將一部分醫院的資產所有權與經營權分離，實行國有民營；另一部分醫院政府完全退出，改制為民辦非營利性醫院或民辦營利性醫院。