審計署6月4日公布了2007年對11個市及其所轄28個縣（市、區）2004年至2006年三個年度國有土地出讓金的審計結果。其中令人欣慰之處在于土地公共財政制度開始發軔：備受矚目的土地出讓金專戶管理在政府的大力推動下開始收效———11城市均設有出讓金財政專戶，將絕大部分出讓金納入了專戶管理，其中重慶市將繳入國庫的土地出讓凈收益全部納入了基金預算管理，這成為土地出讓凈收益基本能夠按照規定用途安排使用的前提。站在進一步建立土地公共財政的角度，審計署建議將土地出讓收支全額納入地方預算管理，接受同級人大監督，是土地財政公共化、法制化的必備步驟，理應堅決落實。

    但審計也暴露出我國土地市場存在三個問題：首先，土地出讓價格在逐年提高，但以地謀財、違規使用出讓金嚴重；其次，我國土地出讓存在混亂狀況，各方所獲土地收益并不匹配；第三，土地出讓計劃不透明成為高價罪魁。
    據國土部近幾年執法檢查的實際數據估算，每年我國新增建設用地95%以上屬于農村集體農用地。據全國政協委員、清華大學教授蔡繼明分析，目前被征地土地收益分配格局大致是：地方政府占20%-30%，企業占40%-50%，村級組織占25%-30%，農民僅占5%-10%。按照征地制度，征用土地的補償款為三年平均農業產量價值的6到10倍，最高標準不超過30倍。根據農業部農村經濟研究中心廖洪樂研究員測算，按最高標準補償，南方地區集體和農民所得補償(人均耕地按0.14公頃計算)僅夠農民23年生活費用，北方地區的補償還不夠20年生活費用。也就是只有將征地補償由現在的30倍提高到45-54倍(南方地區為45倍，北方地區為54倍)，才能保證集體和農民征地前后收入水平基本持平。
    按照此次審計結果，被征地農地補償稍有提高，北京、天津、上海、重慶、合肥、濟南、廣州和成都8城市初步建立了被征地農民社會保障制度，截至2007年9月底，尚有3城市未按照國務院有關要求制定被征地農民社會保障制度。合肥、成都、濟南和天津4城市3年度平均將土地出讓凈收益的6.68%用于被征地農民的社會保障。根據抽查數據，7%左右的土地凈收益用于被征地農民補償，雖然已經上升，但與近兩年50%以上的土地價格上漲相比，征地補償升幅顯然太少。
    其中的主要原因在于，在土地招拍掛環節中，土地管理中心可以控制推出土地的節奏，設定招標基準條件，實行市場競價，而在土地收益分配環節則實行嚴格的政府控制，導致被征地者缺乏價格博弈能力。從表面上看，這樣做降低了中國工業化、城市化成本，但也很容易制造出一批無資產貧民，成為社會持續發展、和諧穩定的障礙。
    土地交易信息不透明也加劇了土地恐慌，推升土地價格上漲。雖然“11城市都設有專門的土地儲備和交易機構，逐步建立了土地出讓的信息公開、地價評估和集體決策制度”，但各地均無土地推出具體規劃，每年推出多少面積，推出幾個地塊，全部臨時通告，人為造成搶地現象。
    至于違規使用出讓金，挪用于建樓堂館所和彌補經費、進行股權投資，甚至挪用被征地農民的社會保障金的機構與官員，按照《土地管理法》、《公務員法》等進行嚴懲，決不能姑息，否則土地黑洞會侵蝕民眾的利益、中國房地產的市場基礎與執政為民的根本。