2009年上半年，廈門空港旅客吞吐量延續了高增長態勢，實現旅客吞吐量523.94萬人，同比增長15.63%，其中一季度實現旅客吞吐量256.36萬人，旅客吞吐量增速自去年二季度下滑到底部后一直穩步上升，并在一季度恢復到兩位數的增長，二季度環比略有增長，達到267.58萬人。
    從客流結構來看，依然是國內航線旅客增長強勁，東南亞航線由于受到經濟衰退以及甲型流感影響，旅客吞吐量出現下滑，目前國際航線旅客占比7%-8%左右。國元證券的報告預測，隨著3季度出行旅客增多以及下半年經濟好轉，全年吞吐量突破千萬基本沒問題。而區別于之前分析的國內其他主要機場，廈門空港今年的客運增速是在上年同期高增長基礎之上取得。
    在貨運方面，以電子工業和出口導向為主的廈門工業遭受了全球經濟危機的嚴重影響，與其他機場一樣，貨運業務不可避免受到拖累，機場6月份貨郵吞吐量1.53萬噸，同比下滑4.1%，但月同比下降幅度正趨于收窄。
    租賃收入方面，影響租金和特許權業務收入的因素主要包括旅客流量特征(旅客總吞吐量、旅客的構成和機場交通量高峰程度)、機場商業設施的面積和位置(總面積、位置和布局)、經營技巧等。
    廈門空港租賃業務采取固定底金加收入提成的方式，提成比例與航空業務量掛鉤，2008年8月完成的新一輪為期4年的招標工作，商業面積和租金水平均有提高，另外在將辦公租賃客戶遷至3號候機樓地下停車場后，商業租賃面積和特許權面積將進一步擴大。在廈門機場換取登機牌后要穿越商業層安檢，合理的結構設計有利于旅客更多的消費，隨著廈門空港旅客吞吐量的穩步增長，租金收入將處于穩定增長的態勢。
    政策方面，國務院常務會議于2009年5月21日討論并原則通過了《國務院關于支持福建省加快建設海峽西岸經濟區的若干意見》，其中明確提到了“建設兩岸直接往來的綜合樞紐，把福建沿海機場、港口等作為兩岸直接‘三通’的首選地。適時增加福建沿海港口為對臺海上貨運直航口岸，推動福建機場與臺灣實現空中直航，增加航班、航線。”這一政策利好引起了資本市場對廈門空港的關注。
    國元證券的分析指出，小三通的成本優勢以及外地旅行團選擇廈門到臺灣的方式也將持續鞏固公司區域航空樞紐的地位。同時，當地旅游業的發展、基地航空公司的引進、支線航線的拓展都將為公司帶來持續發展的動力。
    繼去年收購航空性業務資產以及地勤公司股權后，2009年4月底，公司又公布以6594.31萬元收購空港集團持有的貨機坪和其持有的福建航空港機務公司55%股權；擬與空港集團合作經營廈門機場3號航站樓配套的地下停車場，聯營期20年。
    國都證券的報告認為，本次收購后，廈門機場經營性資產均已裝入上市公司，公司成為廈門空港運行業務的經營主體和機場管理機構，形成了較為完整的航空產業鏈，為廈門空港整體資源的有效利用和管理水平及效率的進一步提高奠定了基礎，也有利于公司治理結構的完善。
    但另一方面，也有報告指出，盡管公司經營穩定，成長性較為明確，但仍不可避免會有各種風險因素。如經濟周期決定航空需求周期，外部需求的減弱極大地影響了以出口帶動的福建省經濟，如經濟走勢進一步惡化，將會影響民航客、貨運需求。另外，為拉動內需，政府也加大了機場投資力度，周邊機場的陸續改、擴建可能分流公司的航空客貨運需求。