針對廣東科技腐敗系列案件所暴露出的科技業務管理部門普遍存在的深層次問題，廣東省、廣州市科技系統提出，對財政投入科研資金管理進行“陽光再造”，發揮市場配置資源的決定性作用，利用先進的信息技術手段，建立起分權制衡、公開透明的管理體系。
　　廣東省科技廳廳長黃寧生認為，汲取此前的教訓，需深化科技體制改革，建立分權制衡、權責統一、科學合理、公開透明的制度流程，是防腐拒變的根本手段。
　　《經濟參考報》記者了解到，去年下半年以來，廣東科技廳對項目管理所涉及的部門(處室)實行橫向分權。涉及科研項目指南編制、評審組織、立項建議、經費分配等關鍵環節，分別由不同部門(處室)負責，每個部門只能對全流程的某個環節具有操作權限，實現“評審權與立項權相制衡、立項權與資金分配權相制約”。有助于堵住以往每個處室負責人都是“老大”，權力“封閉運行”的制度漏洞。
　　“陽光是最好的防腐劑。”黃寧生介紹，利用云計算、大數據處理等最新技術，廣東重新打造一個可以有效連通國家、省、市各級科技管理部門和科研任務承擔單位的“廣東省科技業務管理陽光政務平臺”。
　　記者近日實地參觀廣東省科技廳“科技業務管理陽光政務平臺”看到，科技項目的指南編制、項目申報、立項結果、項目成果等關鍵節點信息，都面向社會公眾充分開放，專家評審意見和分數如實反饋給用戶，“雙盲評審”屏蔽專家姓名，自動回避利益相關專家。采取在線評審方式，減少線下操作和聯系。此外，還實現涵蓋科技業務全流程的“痕跡”長期保存，從業務處經手人到各級審批人的審批意見、時間都在系統中如實顯示，做到責任到人，有效追蹤。同時，系統引進了監察處，對“黑名單申請”等異常情況實時監督。該平臺還向廣東省監察部門、審計財政部門全方位、全天候開放，各部門可實時對科技管理工作進行監督。
　　在廣東省、廣州市科技系統關于財政扶持科研資金管理的“陽光再造”改革中，讓“市場發揮資源配置的決定性作用”成為共識。其具體做法是：財政科技投入由單一的“事前項目補助”改為以科技金融為主的引導性投入，以及后補助、以獎代補、合同補貼等具有比較明確、客觀標準的資助方式，取代目前政府直接將財政資金、公共資源投入到某幾家企業的做法，減少行政權力的尋租空間。
　　廣州市科信局局長馬正勇認為：“財政科研資金應當用在兩個方面，一是引導社會的研發投入的方面，例如政府給企業100萬元，企業應該配套投入1000萬元或更多，還要有相應的產出要求。這樣一舉多贏，既尊重市場的研發方向，產生政府研發投入放大效應，同時對初創期的中小微企業的支持，可以由‘點對點’扶持企業到‘點對面’扶持孵化器的轉變來實現。”
　　不過，有業內人士認為，在“陽光再造”同時需要防止兩個傾向：既不能讓政府“有形之手”過渡干預本該由市場主導的科技資源配置，也不能因噎廢食，削弱政府在原始創新、公益類科研等領域中的主導作用。
　　中國科學院院士盧柯認為，在“市場失靈”的基礎研究、社會公益研究和共性關鍵技術研究領域，“有形之手”的力量尤顯不足。目前我國的基礎研究投入不到R&D經費支出的5%，遠低于創新型國家15%以上的比例。黃寧生介紹，財政資金無償資助應當主要投入不能直接帶來經濟效益的基礎研究、戰略性研究和公共重大民生項目。
　　此外，業內人士認為，在財政扶持科研資金發放環節的“陽光再造”之外，應該根據科研特點，加強對使用環節的考核，避免科研經費發放之后被濫用的現象。應改變科研經費“不拿白不拿”的無償給予，建立科研資金投入產出考核機制。同時，制定科研信用管理制度，加強對公職人員離職后相關約束。