一是含油率高。藻類油脂含量大大高于傳統(tǒng)的油料作物。大豆、棕櫚等油料作物的含油量不足其全部生物量的5%，而藻類含油率最高可達其干重的80%以上，一般也可達到20%-50%。
　　二是生長速度快。藻類的生長和繁殖速度顯著高于傳統(tǒng)的油料作物。藻類在正常生長時生物量每24小時即可翻倍，在指數(shù)生長期，倍增時間甚至可以縮短至3.5小時。
　　三是環(huán)境適應(yīng)性強。藻類對環(huán)境的適應(yīng)能力遠遠優(yōu)于其他油料作物，對生長環(huán)境的要求極低，包括終年被冰雪覆蓋的南北兩極，酸堿度極高或極低的湖泊水潭、鹽堿沼澤甚至鹽度飽和鹵水，大洋深處、高山頂及火山口、地熱溫泉、干旱沙漠等對生命過程極為不利的極端環(huán)境中，都有藻類繁衍生息。
　　四是占用耕地少。藻類是海洋生態(tài)系統(tǒng)的基石，占海洋生物的50%，因而開發(fā)藻類生物燃料可利用廣闊的海洋，其養(yǎng)殖甚至可不占用陸地資源。而現(xiàn)有的油料作物大多為陸生植物，其種植不但會占用大量耕地或林地，甚至會形成與人爭糧的局面，其供給不具備可持續(xù)性。
　　五是環(huán)境友好。藻類生物燃料不會增加溫室氣體的排放，又不會對水資源構(gòu)成威脅。在藻類種植過程中，每增加1噸藻類生物質(zhì)能，需排放相當于2噸化石能源釋放的溫室氣體，但藻類在生長時也需要基本等量的二氧化碳，因而其二氧化碳的凈排放量近似于零。
　　六是副產(chǎn)品附加值高。藻類好比是日光驅(qū)動的細胞工廠，它能將二氧化碳轉(zhuǎn)化為生物燃料、食品、飼料和高價值的生物活性物，而且這些光合微生物還可用于生物除污以及作為固氮生物肥料。大部分藻類在產(chǎn)油的同時，會生產(chǎn)EPA、DHA、蝦青素、胡蘿卜素、藻藍蛋白、飼料蛋白等高附加值產(chǎn)品，這些高附加值產(chǎn)品的綜合利用可以大大加快藻類生物能源的產(chǎn)業(yè)化進程。